סקודה נוסדה בשנת 1895 ע"י וצלאב לורין ווצלאב קלמנט באזור אוסטרו-הונגרי שכיום שייך לצ'כיה. לורין וקלמנט ייצרו תחילה אופניים ולאחר מכן גם אופנועים, ייצור המכוניות החל בשנת 1905 ועד שנת 1925 נקראה החברה בשם לורין & קלמנט (Laurin & Klement). לאחר מלחמת העולם הראשונה ייצרו בחברת לורין & קלמנט גם משאיות. בשנת 1924 חברת לורין & קלמנט נרכשה ע"י תאגיד התעשייה הגדול בצ'כיה "סקודה וורקס" לאחר שמפעלה נפגע משריפה ונקלעה לקשיים כלכליים כך שהיה צורך בשותף עסקי. מאז יוצרו המכוניות תחת המותג "סקודה". לאור המצב הפוליטי בצ'כיה לאחר מלחמת העולם השנייה בודדה סקודה מהעולם המערבי ולכן המכוניות שיוצרו באותה תקופה היו מיושנות ביחס למכוניות המערביות אך הפלת המשטר הקומוניסטי במערב אירופה בשנת 1989 הביאה איתה אפשרויות חדשות וכך פולקסווגן ורנו הציעו לרכוש את חברת סקודה, פולקסווגן נבחרה ע"י ממשלת צ'כיה לחברה שתרכוש את סקודה ותפעל לקידומה בשוק הבינלאומי. בשנת 2000 הושלמה רכישת סקודה ע"י קבוצת פולקסווגן. בשנת 2011 נמכרו 879,200 מרכבי החברה ברחבי העולם. היבואן הרשמי בארץ הוא צ'מפיון מוטורס שהחל ביבוא סדיר לארץ משנת 1996, עד אז היה היבואן איש העסקים שלמה שמלצר. כיום סקודה שולטת בשוק המוניות בישראל ומהווה כרבע מצי הרכב של משטרת ישראל. בשנים 1996 עד 2011 נמכרו בישראל כ-63,000 מכוניות מתוצרת סקודה, מתוכן 9,221 בשנת 2011 לבדה.